分子行为图表:用预测分析加速研究

一个分子的行为是否像“龙虾”或“小龙虾”,可能预示着它有朝一日成为一种药物的能力.

每一次实验都在增进知识
世界杯买球盘口(AbbVie)的研究人员正致力于利用人工智能来帮助预测特定生物制药活性物质的行为.

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Using a field of mathematical simulations called predictive analytics in combination with a new intelligent laboratory automation solution, 研究人员将能够通过每一次实验进一步发展科学知识. 迈克尔Siedler, 研究员兼世界杯买球盘口路德维希港高通量筛选和先进配方科学负责人, 德国实验室, 解释了这项技术对研究人员的影响,并最终, 病人.

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对孩子来说,良好的行为会导致更多的屏幕时间. 对于分子来说,良好的行为可以导致一种救命药物的发现. 无论你是家长还是科学家, 在这种良好行为发生之前预测它的能力可以节省时间, 精力和努力.

而父母就没那么幸运了, 科学家们离破解密码又近了一步:世界杯买球盘口(AbbVie)的研究人员正致力于利用人工智能来帮助预测特定生物制药活性物质的行为.

使用一个称为预测分析的数学模拟领域与一个新的智能实验室自动化解决方案相结合, 研究人员将能够通过每一次实验进一步发展科学知识. 迈克尔Siedler, 研究员兼世界杯买球盘口路德维希港高通量筛选和先进配方科学负责人, 德国实验室, 解释了这项技术对研究人员的影响,并最终, 病人.


问:为什么预测分析对生物制剂研究如此重要?

迈克尔Siedler: 在生物制剂研究领域, 2022世界杯买球盘口家正在建造新的, 非天然分子有望实现更好的治疗. 但与天然分子相比,非天然分子有一个缺点:它们没有经历任何“进化”过程, 哪些是重要的, 除其他原因外, 为了足够的稳定性. 因此, 我们需要在实验室里进行大量的实验来回顾性地稳定这些新分子. 问题是, 现代生物疗法的发展非常复杂, 为了构造稳定的分子, 我们需要大量的数据,这意味着这需要时间和资源,最终可能会延迟开发过程.

这就是预测分析可以发挥作用的地方. 在一般情况下, 我们可以用数据来预测某些事情, 例如亚马逊决定哪些产品可能感兴趣的我基于消费者行为. 在我们的例子中, 我们想要预测某些分子制造基于其结构的稳定性, 以便在实验室中进行更少更有针对性的实验.

“大数据”并不是一个夸张的表达:在一个测试模块中, “Alfons”的平均收藏数为105,408个数据点用于测定生物制药活性物质的稳定性.

问:那么,我们如何着手获取必要的数据呢? 实际的过程是什么样的?

Siedler: 大约四年了, 我们一直致力于在路德维希港实验室实现自动化液体配方筛选的新开发概念, 或“阿尔方斯”.

Alfons是一种新型机器人, 或者更确切地说,是为筛选和分析生物制药分子而建造的一整套自动化仪器装配线. 基本概念是标准化, 使小型化和, 最终, 在筛选这些制造的分子时启用自动化.

简单地说, 这意味着一些事情:1)我们的测试总是在相同的条件下进行, due to standardization; 2) much lower amounts of active substance are required than with conventional methods, 多亏了测试的小型化, which makes us faster and more efficient; and 3) with every new test, 我们收集的数据——经过处理——被添加到一个不断增长的整体数据集中.

第三点是Alfons带来的最重要的好处, 因为我们在每次跑步中获得更多的科学知识. 在某些情况下,结果可以转移到其他分子上. 有了这些知识,我们可以最终带来治疗患者更快和更有效率.

而不是近似. 过去需要200g的活性物质,系统只需要大约. 20克的活性物质,产生大约. 以电子可处理格式提供1000倍以上的数据.

问:Alfons是如何改变你的工作方式的?

Siedler: 我们今天的工作方式与几年前有了很大的不同,甚至在我们团队的构建方式上也是如此. 现在, 我们需要IT领域的专家, 数据和数据库处理, 软件集成与自动化. 这在几年前是不可想象的, 当我们的团队通常由实验室经理和大约三名制药员工组成时, 化学或生物背景.

在过去, 新的活性物质的开发往往是基于和适应其他抗体的经验, 在早期的实验中,哪个效果很好. 在一定程度上,这是基于直觉和模式识别. 但是有了预测分析, 使用我们生成的各种数据, 我们应该能够预测一个新分子的行为以及在什么条件下它是最稳定的. 这从根本上改变了我们的开发过程. 最终, 我们正在从以前对分子的有限理解转向全面理解. 这意味着我们可以预测, 对于一个全新的分子, 它是否以及在什么条件下足够稳定,适合人类使用——无论是“龙虾”还是“小龙虾”."


问:龙虾和小龙虾与药物开发有什么关系?

Siedler: 我们的蛋白质设计师很有创意. 他们给某些抗体命名,如“龙虾”和“小龙虾”,因为它们的形状与某些海洋生物相似.

使用新的分子组合, 其目的是开发更有效和高效地干预人体疾病过程的治疗方法.

问:Alfons的下一步计划是什么?

Siedler: 我们的下一个目标是实现测试的完全自动化. 特定分子格式的数据位置越好, 我们就能更好地用数学模型和, 在理想的情况下, 取代他们. 要做到这一点, 我们必须汇集我们的知识,并以一种随时可供研究人员使用的方式对其进行处理. 这种方式, 我们可以为最严重的疾病开发更多的创新疗法,并使患者尽可能快速有效地获得这些疗法.


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